Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PrkcaP20444 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms