Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VimP20152 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VimP20152 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VimP20152 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VimP20152 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VimP20152 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VimP20152 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VimP20152 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VimP20152 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VimP20152 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VimP20152 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VimP20152 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VimP20152 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VimP20152 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VimP20152 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VimP20152 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VimP20152 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VimP20152 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VimP20152 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VimP20152 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VimP20152 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VimP20152 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VimP20152 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VimP20152 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VimP20152 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VimP20152 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VimP20152 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VimP20152 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VimP20152 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VimP20152 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VimP20152 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VimP20152 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VimP20152 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VimP20152 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VimP20152 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VimP20152 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VimP20152 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VimP20152 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VimP20152 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VimP20152 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VimP20152 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VimP20152 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VimP20152 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VimP20152 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VimP20152 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VimP20152 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VimP20152 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VimP20152 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VimP20152 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VimP20152 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VimP20152 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VimP20152 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VimP20152 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VimP20152 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VimP20152 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VimP20152 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VimP20152 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VimP20152 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VimP20152 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VimP20152 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VimP20152 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VimP20152 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VimP20152 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VimP20152 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VimP20152 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VimP20152 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VimP20152 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VimP20152 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VimP20152 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VimP20152 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VimP20152 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VimP20152 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VimP20152 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VimP20152 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VimP20152 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VimP20152 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VimP20152 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VimP20152 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VimP20152 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VimP20152 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VimP20152 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VimP20152 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VimP20152 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VimP20152 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VimP20152 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VimP20152 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VimP20152 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VimP20152 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VimP20152 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VimP20152 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VimP20152 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VimP20152 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VimP20152 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VimP20152 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VimP20152 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VimP20152 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VimP20152 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VimP20152 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VimP20152 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VimP20152 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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