Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18527 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18527 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
P18527 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
P18527 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P18527 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
P18527 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
P18527 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18527 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18527 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18527 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18527 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18527 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18527 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18527 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18527 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18527 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18527 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18527 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18527 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18527 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18527 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18527 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18527 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18527 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18527 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18527 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms