Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FosbP13346 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FosbP13346 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FosbP13346 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FosbP13346 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FosbP13346 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FosbP13346 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FosbP13346 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FosbP13346 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FosbP13346 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FosbP13346 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FosbP13346 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FosbP13346 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FosbP13346 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FosbP13346 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FosbP13346 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FosbP13346 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FosbP13346 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FosbP13346 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FosbP13346 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FosbP13346 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FosbP13346 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FosbP13346 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FosbP13346 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FosbP13346 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FosbP13346 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FosbP13346 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FosbP13346 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FosbP13346 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FosbP13346 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FosbP13346 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FosbP13346 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FosbP13346 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FosbP13346 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FosbP13346 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FosbP13346 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FosbP13346 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FosbP13346 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FosbP13346 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FosbP13346 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FosbP13346 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FosbP13346 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FosbP13346 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FosbP13346 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FosbP13346 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FosbP13346 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FosbP13346 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FosbP13346 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FosbP13346 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FosbP13346 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FosbP13346 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FosbP13346 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FosbP13346 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FosbP13346 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FosbP13346 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FosbP13346 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FosbP13346 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FosbP13346 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FosbP13346 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FosbP13346 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FosbP13346 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FosbP13346 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FosbP13346 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FosbP13346 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FosbP13346 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FosbP13346 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FosbP13346 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FosbP13346 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FosbP13346 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FosbP13346 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FosbP13346 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FosbP13346 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FosbP13346 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FosbP13346 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FosbP13346 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FosbP13346 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FosbP13346 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FosbP13346 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FosbP13346 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FosbP13346 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FosbP13346 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FosbP13346 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FosbP13346 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FosbP13346 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FosbP13346 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FosbP13346 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FosbP13346 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FosbP13346 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FosbP13346 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FosbP13346 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FosbP13346 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FosbP13346 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FosbP13346 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FosbP13346 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FosbP13346 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FosbP13346 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FosbP13346 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FosbP13346 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FosbP13346 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FosbP13346 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms