Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtcP11725 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtcP11725 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtcP11725 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtcP11725 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtcP11725 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtcP11725 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtcP11725 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtcP11725 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtcP11725 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtcP11725 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtcP11725 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtcP11725 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
OtcP11725 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtcP11725 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtcP11725 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtcP11725 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtcP11725 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtcP11725 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtcP11725 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtcP11725 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtcP11725 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtcP11725 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtcP11725 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtcP11725 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
OtcP11725 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
OtcP11725 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
OtcP11725 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
OtcP11725 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
OtcP11725 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
OtcP11725 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
OtcP11725 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
OtcP11725 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
OtcP11725 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtcP11725 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtcP11725 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtcP11725 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtcP11725 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtcP11725 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtcP11725 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtcP11725 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtcP11725 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtcP11725 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtcP11725 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtcP11725 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtcP11725 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtcP11725 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtcP11725 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtcP11725 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtcP11725 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtcP11725 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtcP11725 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtcP11725 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtcP11725 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtcP11725 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms