Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP11369 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP11369 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP11369 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP11369 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP11369 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP11369 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP11369 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolP11369 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolP11369 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolP11369 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolP11369 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolP11369 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolP11369 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolP11369 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolP11369 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolP11369 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolP11369 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolP11369 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolP11369 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolP11369 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolP11369 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolP11369 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolP11369 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolP11369 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolP11369 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PolP11369 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolP11369 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolP11369 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolP11369 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolP11369 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolP11369 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolP11369 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolP11369 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PolP11369 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PolP11369 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolP11369 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolP11369 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolP11369 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolP11369 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolP11369 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolP11369 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolP11369 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolP11369 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolP11369 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolP11369 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PolP11369 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PolP11369 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolP11369 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PolP11369 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolP11369 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolP11369 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolP11369 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolP11369 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolP11369 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolP11369 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolP11369 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PolP11369 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PolP11369 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PolP11369 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PolP11369 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PolP11369 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PolP11369 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PolP11369 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PolP11369 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PolP11369 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PolP11369 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolP11369 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolP11369 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolP11369 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolP11369 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolP11369 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolP11369 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolP11369 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolP11369 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolP11369 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PolP11369 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PolP11369 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolP11369 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolP11369 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolP11369 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolP11369 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolP11369 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolP11369 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolP11369 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolP11369 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolP11369 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PolP11369 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PolP11369 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PolP11369 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PolP11369 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PolP11369 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PolP11369 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PolP11369 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PolP11369 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PolP11369 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PolP11369 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PolP11369 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PolP11369 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PolP11369 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms