Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P10404 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P10404 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P10404 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P10404 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P10404 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P10404 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P10404 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P10404 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P10404 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
P10404 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P10404 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P10404 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P10404 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P10404 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P10404 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P10404 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P10404 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P10404 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P10404 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P10404 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P10404 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P10404 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P10404 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P10404 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P10404 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P10404 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P10404 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P10404 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P10404 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P10404 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P10404 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
P10404 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
P10404 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
P10404 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
P10404 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P10404 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P10404 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P10404 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P10404 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P10404 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P10404 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P10404 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P10404 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
P10404 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P10404 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
P10404 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P10404 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P10404 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P10404 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P10404 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P10404 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P10404 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P10404 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
P10404 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P10404 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P10404 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P10404 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P10404 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P10404 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P10404 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P10404 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P10404 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P10404 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P10404 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P10404 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms