Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccl2P10148 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccl2P10148 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccl2P10148 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccl2P10148 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccl2P10148 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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