Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa6P09092 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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