Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01669 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01669 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01669 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01669 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01669 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01669 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01669 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01669 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01669 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01669 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01669 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01669 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01669 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01669 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01669 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01669 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01669 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01669 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01669 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01669 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01669 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01669 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01669 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01669 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01669 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01669 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01669 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01669 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01669 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01669 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01669 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01669 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01669 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01669 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01669 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01669 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01669 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01669 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01669 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01669 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01669 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01669 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01669 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01669 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01669 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01669 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01669 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01669 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01669 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01669 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01669 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01669 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01669 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01669 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01669 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01669 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01669 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01669 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01669 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01669 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01669 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01669 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01669 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01669 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01669 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01669 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01669 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01669 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01669 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01669 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01669 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01669 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01669 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01669 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01669 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01669 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01669 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01669 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01669 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01669 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01669 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01669 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01669 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01669 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01669 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01669 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01669 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01669 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01669 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01669 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01669 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01669 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01669 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01669 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01669 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01669 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01669 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01669 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01669 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms