Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnkO88874 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnkO88874 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnkO88874 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnkO88874 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnkO88874 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcnkO88874 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms