Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hcn2O88703 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hcn2O88703 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms