Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnk4O88454 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms