Protein–RNA interactions for Protein: O88447

Klc1, Kinesin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc1O88447 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc1O88447 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc1O88447 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc1O88447 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc1O88447 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klc1O88447 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klc1O88447 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klc1O88447 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klc1O88447 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms