Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkcO88445 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkcO88445 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkcO88445 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkcO88445 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkcO88445 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkcO88445 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkcO88445 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkcO88445 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkcO88445 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AurkcO88445 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms