Protein–RNA interactions for Protein: O88273

Grem2, Gremlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grem2O88273 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grem2O88273 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Grem2O88273 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grem2O88273 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grem2O88273 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Grem2O88273 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grem2O88273 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grem2O88273 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grem2O88273 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grem2O88273 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Grem2O88273 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Grem2O88273 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Grem2O88273 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Grem2O88273 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grem2O88273 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grem2O88273 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grem2O88273 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grem2O88273 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grem2O88273 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grem2O88273 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grem2O88273 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grem2O88273 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grem2O88273 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Grem2O88273 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grem2O88273 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grem2O88273 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grem2O88273 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grem2O88273 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms