Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Vamp4O70480 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp4O70480 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp4O70480 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp4O70480 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp4O70480 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp4O70480 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp4O70480 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp4O70480 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp4O70480 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp4O70480 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp4O70480 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp4O70480 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp4O70480 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp4O70480 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp4O70480 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp4O70480 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp4O70480 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp4O70480 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp4O70480 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp4O70480 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp4O70480 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp4O70480 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vamp4O70480 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vamp4O70480 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vamp4O70480 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vamp4O70480 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vamp4O70480 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vamp4O70480 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vamp4O70480 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vamp4O70480 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms