Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb5O70309 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms