Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ChkbO55229 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChkbO55229 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChkbO55229 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ChkbO55229 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChkbO55229 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChkbO55229 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChkbO55229 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms