Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek2O35942 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek2O35942 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek2O35942 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek2O35942 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek2O35942 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek2O35942 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nek2O35942 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek2O35942 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Nek2O35942 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Nek2O35942 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek2O35942 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek2O35942 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek2O35942 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms