Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf18O35714 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms