Protein–RNA interactions for Protein: O35654

Pold2, DNA polymerase delta subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold2O35654 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pold2O35654 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pold2O35654 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pold2O35654 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pold2O35654 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pold2O35654 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pold2O35654 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pold2O35654 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pold2O35654 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pold2O35654 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms