Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edil3O35474 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edil3O35474 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edil3O35474 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edil3O35474 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Edil3O35474 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Edil3O35474 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edil3O35474 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Edil3O35474 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edil3O35474 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edil3O35474 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Edil3O35474 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms