Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6aO35464 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6aO35464 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6aO35464 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sema6aO35464 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6aO35464 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6aO35464 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6aO35464 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6aO35464 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6aO35464 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6aO35464 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6aO35464 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6aO35464 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6aO35464 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6aO35464 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6aO35464 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6aO35464 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6aO35464 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6aO35464 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sema6aO35464 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6aO35464 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6aO35464 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6aO35464 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6aO35464 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sema6aO35464 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6aO35464 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6aO35464 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6aO35464 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6aO35464 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6aO35464 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sema6aO35464 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6aO35464 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6aO35464 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6aO35464 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6aO35464 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6aO35464 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6aO35464 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6aO35464 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6aO35464 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6aO35464 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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Sema6aO35464 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sema6aO35464 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Sema6aO35464 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Sema6aO35464 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Sema6aO35464 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sema6aO35464 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sema6aO35464 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sema6aO35464 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sema6aO35464 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sema6aO35464 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sema6aO35464 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Sema6aO35464 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Sema6aO35464 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema6aO35464 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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