Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atf6bO35451 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6bO35451 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms