Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Xbp1O35426 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms