Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe40O35185 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms