Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sypl1O09117 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sypl1O09117 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms