Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EllO08856 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EllO08856 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EllO08856 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EllO08856 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EllO08856 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
EllO08856 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EllO08856 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EllO08856 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EllO08856 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EllO08856 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EllO08856 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EllO08856 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EllO08856 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EllO08856 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EllO08856 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EllO08856 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EllO08856 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
EllO08856 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EllO08856 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EllO08856 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EllO08856 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EllO08856 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EllO08856 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EllO08856 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EllO08856 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EllO08856 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
EllO08856 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EllO08856 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EllO08856 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EllO08856 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EllO08856 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EllO08856 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EllO08856 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EllO08856 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EllO08856 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
EllO08856 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EllO08856 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
EllO08856 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
EllO08856 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
EllO08856 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms