Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC024978J3QPC3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms