Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21972J3QN38 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Gm21972J3QN38 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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Gm21972J3QN38 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21972J3QN38 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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