Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK1

Sgo2b, Shugoshin 2B, mousemouse

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Length 1,167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2bJ3QMK1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sgo2bJ3QMK1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2bJ3QMK1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2bJ3QMK1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2bJ3QMK1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2bJ3QMK1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2bJ3QMK1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2bJ3QMK1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2bJ3QMK1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2bJ3QMK1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2bJ3QMK1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2bJ3QMK1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2bJ3QMK1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2bJ3QMK1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2bJ3QMK1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2bJ3QMK1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2bJ3QMK1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2bJ3QMK1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2bJ3QMK1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2bJ3QMK1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2bJ3QMK1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2bJ3QMK1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2bJ3QMK1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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