Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm21863J3KMP8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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