Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
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Gm20830J3KML6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Gm20830J3KML6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20830J3KML6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms