Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcf11G3X9Z4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcf11G3X9Z4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms