Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf148G3X9R7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf148G3X9R7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf148G3X9R7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf148G3X9R7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf148G3X9R7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf148G3X9R7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf148G3X9R7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf148G3X9R7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf148G3X9R7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf148G3X9R7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf148G3X9R7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf148G3X9R7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf148G3X9R7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf148G3X9R7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf148G3X9R7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf148G3X9R7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf148G3X9R7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf148G3X9R7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf148G3X9R7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf148G3X9R7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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