Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgxb3G3X9M3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms