Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccl26F8VQM2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl26F8VQM2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms