Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ercc6F8VPZ5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ercc6F8VPZ5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms