Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Colca2F8VPY8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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