Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arid4aF8VPQ2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arid4aF8VPQ2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arid4aF8VPQ2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Arid4aF8VPQ2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arid4aF8VPQ2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arid4aF8VPQ2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arid4aF8VPQ2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arid4aF8VPQ2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arid4aF8VPQ2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arid4aF8VPQ2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arid4aF8VPQ2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arid4aF8VPQ2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arid4aF8VPQ2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arid4aF8VPQ2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Arid4aF8VPQ2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Arid4aF8VPQ2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arid4aF8VPQ2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arid4aF8VPQ2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arid4aF8VPQ2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arid4aF8VPQ2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arid4aF8VPQ2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arid4aF8VPQ2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arid4aF8VPQ2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Arid4aF8VPQ2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Arid4aF8VPQ2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms