Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5160F8VPN3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms