Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28038F7BCN9 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms