Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Igkv1-99F6XWB2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms