Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Crocc2F6XLV1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crocc2F6XLV1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms