Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gm5861F6VCN9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5861F6VCN9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5861F6VCN9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5861F6VCN9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm5861F6VCN9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5861F6VCN9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5861F6VCN9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5861F6VCN9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5861F6VCN9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5861F6VCN9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5861F6VCN9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5861F6VCN9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5861F6VCN9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5861F6VCN9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5861F6VCN9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5861F6VCN9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm5861F6VCN9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5861F6VCN9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5861F6VCN9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5861F6VCN9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm5861F6VCN9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms