Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngap1F6SEU4 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms