Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Raph1F2Z3U3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms