Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmod3E9QA62 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod3E9QA62 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms