Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Gm5407E9Q7Q1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Gm5407E9Q7Q1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Gm5407E9Q7Q1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Gm5407E9Q7Q1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Gm5407E9Q7Q1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Gm5407E9Q7Q1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Gm5407E9Q7Q1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Gm5407E9Q7Q1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Gm5407E9Q7Q1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Gm5407E9Q7Q1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm5407E9Q7Q1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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